באופן כללי, בפרקטיקה הקלינית, השימוש בחומרי חיטוי כימיים כולל את ארבע השיטות הבאות:
1. שיטת טבילה, הכרוכה בכביסה וייבוש הפריט החטוי, ואז טבילה אותו בתמיסה חמורה של ריכוז מוגדר לפרק זמן מסוים.
2. שיטת ניגוב: טבילה בחומר חיטוי כימי של ריכוז מוגדר כדי לנגב את פני השטח ואת רירית העור של פריטים מזוהמים. 3. שיטת ריסוס: בתוך הזמן שצוין, השתמש בתרסיס כדי לרסס באופן שווה ריכוז מסוים של חומר חיטוי כימי על שטח החלל ומשטח האובייקט לחיטוי.
4. שיטת חיטוי, שיטה לחיטוי ועיקור בחלל סגור על ידי חימום או הוספת ריכוז מסוים של חומר חיטוי או חמצון לייצור גז תוך זמן מוגדר.
